<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Microbiology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Microbiology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Микробиология</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0026-3656</issn><issn publication-format="electronic">3034-5464</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">The Russian Academy of Sciences</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">698749</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.7868/S3034546425060043</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>EXPERIMENTAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Hydrocarbon-Oxidizing Actinomycetes from Lake Sapropel</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>УГЛЕВОДОРОДОКИСЛЯЮЩИЕ АКТИНОМИЦЕТЫ ИЗ ОЗЕРНОГО САПРОПЕЛЯ</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Babich</surname><given-names>T. L.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бабич</surname><given-names>Т. Л.</given-names></name></name-alternatives><email>microb101@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sokolova</surname><given-names>D. Sh.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Соколова</surname><given-names>Д. Ш.</given-names></name></name-alternatives><email>microb101@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Zotova</surname><given-names>A. N.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Зотова</surname><given-names>А. Н.</given-names></name></name-alternatives><email>microb101@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Gracheva</surname><given-names>T. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Грачева</surname><given-names>Т. А.</given-names></name></name-alternatives><email>microb101@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Winogradsky Institute of Microbiology, Research Centre of Biotechnology of the Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Институт микробиологии им. С.Н. Виноградского, ФИЦ Биотехнологии РАН</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Lomonosov Moscow State University, Department of Soil Science</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, факультет почвоведения</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-12-16" publication-format="electronic"><day>16</day><month>12</month><year>2025</year></pub-date><volume>94</volume><issue>6</issue><issue-title xml:lang="en">VOL 94, NO6 (2025)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">ТОМ 94, №6 (2025)</issue-title><fpage>540</fpage><lpage>548</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-12-16"><day>16</day><month>12</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Russian Academy of Sciences</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Российская академия наук</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Russian Academy of Sciences</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Российская академия наук</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" start_date="2026-12-16"/></permissions><self-uri xlink:href="https://snv63.ru/0026-3656/article/view/698749">https://snv63.ru/0026-3656/article/view/698749</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>A high number of culturable bacteria of the genus Streptomyces (7.84 ± 0.9) × 10<sup>7</sup> CFU/g was revealed in the actinomycete community of lake sapropel of OOO TPK Kamskiy Sapropel (Naberezhnye Chelny, Republic of Tatarstan, Russian Federation). A total of 14 strains of streptomycetes were isolated in pure culture, growing in a wide range of temperatures and sodium chloride content, possessing hydrolytic, antibiotic and urease activity, capable of biofilm growth, changing the rheological characteristics of the culture fluid when growing on crude oil (Δσ interfacial tension up to 23 mN/m). The ability of streptomycetes to degrade oil n-alkanes with a chain length of C<sub>11</sub>−C<sub>30</sub> was revealed; the addition of starch to the medium activated this process. This makes streptomycetes promising agents both for use in biotechnologies for enhancing oil recovery and in the creation of biopreparations for cleaning soils from oil and oil products.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В актиномицетном сообществе озерного сапропеля ООО ТПК “Камский сапропель” (Набережные Челны, Республика Татарстан, РФ) выявлена высокая численность культивируемых бактерий рода Streptomyces (7.84 ± 0.9) × 10<sup>7</sup> КОЕ/г. В чистую культуру выделено 14 штаммов стрептомицетов, растущих в широком диапазоне температур и содержания хлорида натрия, обладающих гидролитической, антибиотической и уреазной активностью, способных к биопленочному росту, при росте на сырой нефти изменяющих реологические характеристики культуральной жидкости (Δσ межфазного натяжения до 23 мН/м). Выявлена способность стрептомицетов деградировать н-алканы нефти с длиной цепи C<sub>11</sub>−C<sub>30</sub>, внесение крахмала в среду активировало этот процесс. Это делает стрептомицеты перспективными агентами как для использования в биотехнологиях повышения нефтеизвлечения пластов, так и при создании биопрепаратов по очистке почв от загрязнения нефтью и нефтепродуктами.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>sapropel</kwd><kwd>streptomycetes</kwd><kwd>oil biodegradation</kwd><kwd>biotechnologies for enhancing oil recovery</kwd><kwd>urease activity</kwd><kwd>antibiotics</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>сапропель</kwd><kwd>стрептомицеты</kwd><kwd>биодеградация нефти</kwd><kwd>биотехнологии увеличения нефтеотдачи пластов</kwd><kwd>уреазная активность</kwd><kwd>антибиотики</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="en">This work was funded by the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation.</funding-statement><funding-statement xml:lang="ru">Работа поддержана Министерством науки и высшего образования Российской Федерации.</funding-statement></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Белов А.А., Чепцов В.С., Лысак Л.В. Методы идентификации почвенных микроорганизмов. М.: ООО “МАКС Пресс”, 2020. 196 с.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Беляев С.С., Борзенков И.А., Назина Т.Н., Розанова Е.П., Глумов И.Ф., Ибатуллин Р.Р., Иванов М.В. Использование микроорганизмов в биотехнологии повышения нефтеизвлечения // Микробиология. 2004. Т. 73. С. 687–697.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Гаузе Г.Ф., Преображенская Т.П., Свешникова М.А., Терехова Л.П., Максимова Т.С. Определитель актиномицетов: роды Streptomyces, Streptoverticillium, Chainia. М.: Наука, 1983. 248 с.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Гоголева О.А., Немцева Н.В. Углеводородокисляющие микроорганизмы природных экосистем // Бюлл. Оренбургского научного центра УРО РАН. 2012. № 2. С. 1–7.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Гусева Ю.З., Алтунина Л.К., Сваровская Л.И. Исследование углеводородного состава вязкой нефти при вытеснении комплексным методом с применением уреазы // Химия в интересах устойчивого развития. Томск: Изд-во Сибирского отделения РАН, 2016. № 5. С. 679–686. http://dx.doi.org/10.15372/KhUR20160512</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Звягинцев Д.Г., Зенова Г.М. Экология актиномицетов. М.: ГЕОС, 2001. 256 с.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Методы почвенной биохимии и микробиологии. М.: Изд-во Моск. ун-та, 1991. 304 с.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Миних А.А., Хисамов Р.С., Хисаметдинов М.Р., Назина Т.Н., Ганеева З.М., Каримова А.Р. Способ разработки карбонатного нефтяного пласта (варианты). Патент RU № 2610051 C1. Заявка № 2016106863 от 25.02.2016. дата публ. заявки 07.02.2017. Бюл. № 4.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Назина Т.Н., Павлова Н.К., Татаркин Ю.В., Шестакова Н.М., Бабич Т.Л., Соколова Д.Ш., Ивойлов В.С., Хисаметдинов М.Р., Ибатуллин Р.Р., Турова Т.П., Беляев С.С., Иванов М.В. Микроорганизмы карбонатной нефтяной залежи 302 Ромашкинского месторождения и их биотехнологический потенциал // Микробиология. 2013. Т. 82. С. 191–202.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Плаксин Г.В., Кривонос О.И. Термохимическая переработка озерных сапропелей: состав и свойства продуктов // Российский химический журнал. 2007. Т. LI. № 4. С. 140–147.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Adkins J.P., Cornell L.A., Tanner R.S. Microbial composition of carbonate petroleum reservoir fluids // Geomicrobiol. J. 1992. V. 10. P. 87–97.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Akinsanola B.A., Adebisi O.O., Osemwegie O.O. Assessment of biosurfactant production and petroleum hydrocarbons biodegradation capability of actinomycetes isolated from soils // Tropic. J. Nat. Product Res. (TJNPR). 2024. V. 8. Р. 7321‒7329. https://doi.org/10.26538/tjnpr/v8i5.39</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Baniasadi F., Shahidi G.H., Karimi Nik A. In vitro petroleum decomposition by actinomycetes isolated from petroleum contaminated soil // Amer.-Euras. J. Agric. Environ. Sci. 2009. V. 6. Р. 268–270.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Brunk C.F., Avaniss-Aghajani E., Brunk C.A. A computer analysis of primer and probe hybridization potential with bacterial small-subunit rRNA sequences // Appl. Environ. Microbiol. 1996. V. 61. P. 872–879.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>De Schrijver A., De Mot R. Degradation of pesticides by actinomycetes // Crit. Rev. Microbiol. 1999. V. 25. Р. 85–119. https://doi.org/10.1080/10408419991299194</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Dorchenkova Y.A., Gracheva T.A., Babich T.L., Sokolova D.Sh., Alexandrova A.V., Pham Giang T.H., Lysak L.V., Golovchenko A.V., Manucharova N.A. Soil actinomycetes of Vietnam tropical forests // Forests. 2022. V. 13. Art. 1895903. https://doi.org/10.3390/f13111863</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Eldourghamy A., Elsabagh S., Ismail A. Biodegradation of diesel oil wastes for production of biosurfactants by two Actinomycetes strains // Res. J. Appl. Biotechnol. 2015. V. 1. Р. 64–79. https://doi.org/10.21608/rjab.2015.53532</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Francy D.S., Thomas J.M. Raymond R.L. Ward C.H. Emulsification of hydrocarbons by surface bacteria // J. Ind. Microbiol. 1991. V. 8. P. 237–246.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Fuentes M.S., Benimeli C.S., Cuozzo S.A., Amoroso M.J. Isolation of pesticide-degrading actinomycetes from a contaminated site: bacterial growth, removal and dechlorination of organochlorine pesticides // Int. Biodeterior. Biodegrad. 2010. V. 64. Р. 434–441. https://doi.org/10.1016/j.ibiod.2010.05.001</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Hammer Ø., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. 2001. V. 4. № 1. P. 9.</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Kanehisa M., Goto S. KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes // Nucl. Acids Res. 2000. V. 28. P. 27–30.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>López O.V., Castillo L.A., Ninago M.D., Ciolino A.E., Villar M.A. Modified starches used as additives in Enhanced Oil Recovery (EOR) // Ind. Applic. Renewable Biomass Prod. 2017. Р. 227–2487. https://doi.org/10.1007/978-3-319-61288-1_9</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Metsalu T., Vilo J. ClustVis: a web tool for visualizing clustering of multivariate data using principal component analysis and heatmap // Nucl. Acids Res. 2015. V. 43 (W1). P. W566–W570. https://doi.org/10.1093/nar/gkv468</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Nagpal S., Haque M.M., Singh R., Mande S.S. iVikodak-A platform and standard workflow for inferring, analyzing, comparing, and visualizing the functional potential of microbial communities // Front. Microbiol. 2019. V. 9. Art. 3336. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.03336</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Nemati M., Voordouw G. Modification of porous media permeability, using calcium carbonate produced enzymatically in situ // Enzyme Microb. Technol. 2003. V. 33. Р. 635–642.</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>Neu T.R. Significance of bacterial surface-active compounds in interaction of bacteria with interfaces // Microbiol. Rev. 1996. V. 60. Art. 151.</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>Raut S.S., Kharade P.B., Mohalkar Y.V., Khalge S.S., Dr. K. Sunil D. Review on: An Overview of an Actinomycetes and its application // JETIR. 2023. V. 10. P. e394–e406.</mixed-citation></ref><ref id="B28"><label>28.</label><mixed-citation>Selim M.S.M., Abdelhamid S.A., Mohamed S.S. Secondary metabolites and biodiversity of actinomycetes // J. Genet. Eng. Biotechnol. 2021. V. 19. Р. 72. https://doi.org/10.1186/s43141-021-00156-9.</mixed-citation></ref><ref id="B29"><label>29.</label><mixed-citation>Shirling E.B., Gottlieb D. Methods for characterization of Streptomyces species // Int. J. Syst. Bact. 1966. V. 16. P. 313–340.</mixed-citation></ref><ref id="B30"><label>30.</label><mixed-citation>Sokolova D.Sh., Babich T.L., Semenova E.M., Khisametdinov M.R., Mardanov A.V., Minikh A.A., Nazina T.N. Microbiological characteristics of sapropel and the possibility of its application for enhanced oil recovery from carbonate reservoirs // Microbiology (Moscow). 2024. V. 93. Р. S15–S20.</mixed-citation></ref><ref id="B31"><label>31.</label><mixed-citation>Vidya T.V., Growther L. Biodegradation promising solution to the rubber waste and for rubber industry by the Streptomyces diastaticus from soil // Res. J. Biotechnol. 2019. V. 14. Р. 93‒99.</mixed-citation></ref><ref id="B32"><label>32.</label><mixed-citation>Weisburg W.G., Barns S.M., Pelletier D.A., Lane D.J. 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 697–703.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
