Влияние pH на конформацию модифицированного аптамера к белку нуклеолину
- Авторы: Габрусенок П.В1, Рамазанов Р.Р2, Бучельников А.С2, Соколов П.А1,2
-
Учреждения:
- Санкт-Петербургский государственный университет
- Севастопольский государственный университет
- Выпуск: Том 68, № 2 (2023)
- Страницы: 241-247
- Раздел: Статьи
- URL: https://snv63.ru/0006-3029/article/view/673548
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0006302923020047
- EDN: https://elibrary.ru/CAEFMD
- ID: 673548
Цитировать
Аннотация
Поиск агентов для адресной доставки противораковых препаратов остается крайне востребованной для медицины задачей. В этой связи находят свое применение ДНК-аптамеры к белкам, специфичным к раковым клеткам. Вместе с тем дополнительная настройка активности аптамеров для снижения их аффинности к мишеням вне раковых тканей может улучшить перспективы их клинического применения ввиду сокращения иммуногенности и количества побочных эффектов. Одним из подходов является использование нарушения кислотности в раковых клетках и тканях. В данной работе мы модифицировали аптамер AS1411 к нуклеолину путем присоединения к нему нуклеотидной последовательности, сообщающей аптамеру свойство pH-чувствительности. Методами спектрофотометрического плавления и флуоресценции было продемонстрировано, что конформация нового аптамера обусловлена pH среды.
Ключевые слова
Об авторах
П. В Габрусенок
Санкт-Петербургский государственный университетСанкт-Петербург, Россия
Р. Р Рамазанов
Севастопольский государственный университетСевастополь, Россия
А. С Бучельников
Севастопольский государственный университетСевастополь, Россия
П. А Соколов
Санкт-Петербургский государственный университет;Севастопольский государственный университет
Email: p.a.sokolov@spbu.ru
Санкт-Петербург, Россия;Севастополь, Россия
Список литературы
- F. Mongelard and P. Bouvet, Trends Cell Biol., 17 (2), 80 (2007).
- S. Christian, J. Pilch, M. E. Akerman, et al., J. Cell Biol., 163 (4), 871 (2003).
- J. Mosafer and A. Mokhtarzadeh, Curr. Drug Delivery, 15 (9), 1323 (2018).
- C. Brignole, V. Bensa, N. A. Fonseca, et al., J. Exp. Clin. Cancer Res., 40 (1), 180 (2021).
- J. BalQa-Silva, A. do Carmo, H. Tao, et al., Exp. Cell Res., 370 (1), 68 (2018).
- V. Moura, M. Lacerda, P. Figueiredo, et al., Breast Cancer Res. Treat., 133 (1), 61 (2012).
- J. Carvalho, A. Paiva, M. P. Cabral Campello, et al., Sci. Rep., 9 (1), 7945 (2019).
- N. F. Hosseini, R. Amini, M. Ramezani, et al., Biomed. Pharmacother., 155, 113690 (2022).
- С. П. Радько, С. Ю. Рахметова, Н. В. Бодоев и др., Биомед. химия, 53 (1), 5 (2007).
- С. А. Лапа, В. Е. Шершов, Г. С. Краснов и др., Биоорг. химия, 46 (4), 411 (2020).
- Z. Fu and J. Xiang, Int. J. Mol. Sci., 21 (8), 2793 (2020).
- R. Yazdian-Robati, P. Bayat, F. Oroojalian, et al., Int. J. Biol. Macromol., 155, 1420 (2020).
- B. A. Webb, M. Chimenti, M. P. Jacobson, et al., Nat. Rev. Cancer, 11 (9), 671 (2011).
- M. Damaghi, J. W. Wojtkowiak, and R. J. Gillies, Front. Physiol. 4, 370 (2013).
- I. A. P. Thompson, L. Zheng, M. Eisenstein, et al., Nat.Commun., 11 (1), 2946 (2020).
- M. Debiais, A. Lelievre, M. Smietana, et al., Nucl. Acids Res., 48 (7), 3400 (2020).
- https://eu.idtdna.com/calc/analyzer.
- P. A. Rachwal and K. R. Fox, Methods, 43 (4), 291 (2007).
- J. A. Lee and M. C. DeRosa, Chem.Commun., 46 (3), 418 (2010).
- L. Bie, Y. Wang, F. Jiang, et al., Front. Mol. Biosci., 9, 1025313 (2022).
- F. C. Simmel, B. Yurke, and H. R. Singh, Chem. Rev., 119 (10), 6326 (2019).
- S. E. Morse and D. E. Draper, Nucl. Acids Res., 23 (2), 302 (1995).
Дополнительные файлы
