Пространственная структура молекулы сойморфина-6

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Методом теоретического конформационного анализа исследованы конформационные возможности молекулы сойморфина-6 (Tyr1-Pro2-Phe3-Val4-Val5-Asn6-NH2). Потенциальная функция системы выбрана в виде суммы невалентных, электростатических и торсионных взаимодействий и энергии водородных связей. Найдены низкоэнергетические конформации молекулы сойморфина-6, значения двугранных углов основных и боковых цепей аминокислотных остатков, входящих в состав молекулы, оценена энергия внутри- и межостаточных взаимодействий. Показано, что пространственная структура молекулы сойморфина-6 представляется конформациями восьми шейпов пептидного скелета. Полученные результаты могут быть использованы для выяснения структурной и структурно-функциональной организации молекул сойморфинов .

Об авторах

Л. Н Агаева

Бакинский государственный университет

Email: leylanamig@mail.ru
Баку, Азербайджан

А. А Абдинова

Азербайджанский государственный педагогический универcитет

Баку, Азербайджан

С. Р Ахмедова

Азербайджанский тexнический университет

Баку, Азербайджан

Н. Ф Ахмедов

Бакинский государственный университет

Баку, Азербайджан

Н. А Ахмедов

Бакинский государственный университет

Баку, Азербайджан

Список литературы

  1. Е. А. Чеснокова, Н. Ю. Сарычева, В. А. Дубынин и А. А.Каменский, Успехи физиол. наук, 46 (1), 22 (2015).
  2. E. De Azevedo, Rev. Saude Publica, 45 (4), 1 (2011).
  3. K. Kaneko, M. Iwaski, M. Yoshikawa, and K. Ohinata, Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol., 299 (3), G799 (2010).
  4. K. Ohinata, S. Agui, and M. Yoshikawa, Biosci. Biotechnol. Biochem., 71 (10), 2618 (2007).
  5. S. Yang, S. Sonoda, L. Chen, and M. Yoshikawa, Peptides, 24 (4), 503 (2003).
  6. S. Yang, J. Yunden, S. Sonoda, et al., FEBS Lett., 509, 213 (2001).
  7. Н. А. Ахмедов, Н. М. Годжаев, Е. В. Сулейманова и Е. М. Попов, Биоорганич. химия, 16 (5), 661 (1990).
  8. Н. А. Ахмедов, Молекуляр. биология, 23, 240 (1989).
  9. N. A. Akhmedov, Z. H. Tagiyev, E. M. Hasanov, and G. A. Akhverdieva, J. Mol. Structure, 646, 75 (2003).
  10. N. A. Akhmedov, L. I. Ismailova, R. M. Abbasli, et al., IOSR J. Appl. Phys. (IOSR-JAP), 8, 66 (2016).
  11. N. A. Akhmedov, R. M. Abbasli, L. N. Agayeva, and L. I. Ismailova, In Modern Trends In Physics (Conf. Proceed., 2019), V. II, p. 201.
  12. N. A. Akhmedov, L. N. Agayeva, G. A. Akverdieva, et al., J. Chem. Soc. Pak., 43 (5), 500 (2021).
  13. N. A. Akhmedov, L. N. Agayeva, S. R. Akhmedova, et al., IOSR J. Appl. Phys. (IOSR-JAP), 13 (5), 62 (2021).
  14. Л. Н. Агаева, А. А. Абдинова, С. Р. Ахмедова и Н. А. Ахмедов, Биофизика, 66 (4), 629 (2021).
  15. Н. А. Ахмедов, Л. Н. Агаева, Ш. Н. Гаджиева и др., Актуальные вопросы биологич. физики и химии, 4 (1) 63 (2019).
  16. L. i. Ismailova, R. M. Abbasli, and N. A. Akhmedov, In Proc.Int. Conf. COIA (2020), V. I, p. 218.
  17. IUPAC-IUB. Quantities, Units and Symbols in Physical Chemistry (Blackwell Scientific, Oxford, 1993).

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2023